기능적 적응은 해당 종 또는 그 전임자의 생존을 돕기 위해 종의 진화 역사에서 언젠가 발생한 구조 또는 행동입니다. 예를 들어, 방수 달걀 껍질은 투과성 달걀 껍질이 말라버린 건조한 건조 환경에 알을 낳기 위해 파충류들 사이에서 발생한 기능적 적응입니다.
기능적 적응은 진화의 핵심입니다. 유기체의 생존 가능성을 높이는 구조는 자연 선택에 의해 강력하게 선호되므로 특성이 고정되고 인구의 모든 구성원이 이를 갖게 될 때까지 한 세대에서 다음 세대로 점점 더 많은 수로 나타납니다. 때로는 기능적 적응으로 인해 한 기능에서 다른 기능으로 전환됩니다. 대표적인 것이 깃털이다. 깃털은 중생대에 일부 공룡 종의 단열재 형태로 나타났습니다. 그들은 이 종에서 단열재로 기능했습니다. 시간이 지나면서 일부 깃털의 모양이 바뀌어 현생 조류의 조상 사이에서 날아갈 수 있게 되었습니다. 따라서 깃털은 새가 진화하는 과정에서 새로운 기능을 갖게 되었습니다.
한때 기능적이었던 적응은 그 기능을 상실할 수 있습니다. 이러한 흔적적 적응이 항상 쓸모없는 것은 아닙니다. 인간의 미골이나 꼬리뼈는 흔적적 적응의 한 예입니다. 이는 여전히 근육의 부착점 역할을 하지만 조상의 형태에 비해 기능이 크게 저하된 것으로 간주됩니다.